El CIAT recibe apoyo financiero y técnico de instituciones internacionales, nacionales y locales:

Entre las instituciones internacionales destacan:

CIP Centro Internacional de la Papa

JICA Agencia de Cooperación Japonesa

PNUD Programa para el Desarrollo de las Naciones Unidas

CYMMIT Centro Internacional de Manejo de Maíz y Trigo
IERM Edimburgo - Escocia
NRI Gobierno Británico
DFID, Cooperación con personal técnico asignado al Programa Forestal (Gran Bretaña)
DED, Cooperación con personal técnico asignado al Programa Forestal (Alemania)
ODI, Economía Forestal a nivel comunal. (Inglaterra) y  Forestería Comunitaria. (Inglaterra)
CABI, Sanidad de árboles. (Inglaterra)
UNIV. OXFORD, Guías para la biodiversidad. (Inglaterra), Especies leguminosas. (Inglaterra)
CIAT, Intercambio de germoplasma de leguminosas. (Colombia)
INBAR., Cadena Productiva del Bambú. (China)
ITE, Proyección del banco de semillas Forestales a largo plazo. (Escocia)
CATIE, Curso Nacional de SAF. (Costa Rica) y Curso sobre MIRASILV para plantaciones Forestales. (Costa Rica)
UNIV. BANGOR, Evaluación de SAF. (País de Gales)
UNIV. FLORENCIA, Desarrollo de un CD interactivo de especies forestales. (Italia)
UNIV. LANCASHIERE, Cooperación con personal técnico asignado al Programa Forestal (Inglaterra)
UNIV. Sueca de Agricultura, Evaluación de SAF . (Suecia)

UNIV. KVL, Capacitación en Forestería comunitaria. (Dinamarca)
UNIV. SUNY, Aplicación de SIG en manejo y conservación de bosques (USA)
UNIV. WOLVERHAMPTON, El enfoque de Medios de Vida Sostenible (Inglaterra)
ICRAF, Desarrollo de sistemas agroforestales. (Kenya – Perú)
KEW GARDENS, Identificación de especies del género Inga. (Inglaterra)
NifTAL, el Programa de Asesores Holandeses (P.A.H.)  apoya Rhizobiología

Empresa Brasileña de Pesquisa Agropecuaria (EMBRAPA) especialmente con técnicos del Centro Nacional de Pesquisa de Soya

CNPSo., apoya al proyecto Soya
EMBRAPA/BRASIL, CIAT/COLOMBIA y IRRI/FILIPINAS Convenios Internacionales para la introducción de Germoplasma de Arroz
Expertos Japoneses del Proyectos DISAPA-JICA asesoran en temas como son: Mejoramiento de líneas; pruebas de tolerancia a la sequía, prueba de resistencia a enfermedades; calidad de granos y otros.
FOSEFOR, Establecimiento de fuentes semilleras Forestales. (Ecuador)
PRODISA-BELGA, Capacitación e instalación en Sistemas Agroforestales (SAF).

Las instituciones nacionales que nos apoyan son:

Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural a traves de tres fundaciones la de los Valles, el Chaco y el Trópico Humedo

VIPFE Viceministerio de Inversión Pública y Financiamiento Externo

SIBTA Sistema Boliviano de Tecnología Agropecuaria

A nivel local se recibe apoyo de:

Prefectura de Santa Cruz

PRODISA-BELGA, Capacitación e instalación en Sistemas Agroforestales (SAF).